醫(yī)療基金是指未納入公費醫(yī)療開支范圍內的事業(yè)單位，按照當?shù)刎斦块T規(guī)定的公費醫(yī)療經(jīng)費開支標準從收入中提取，并參照公費醫(yī)療制度有關規(guī)定用于職工公費醫(yī)療的開支。
醫(yī)療基金應按從事專業(yè)業(yè)務及其輔助活動的人員和從事生產(chǎn)經(jīng)營活動的人員分別列入事業(yè)支出和經(jīng)營支出的社會保障費。其計算公式為：
醫(yī)療基金提取額=職工人數(shù)*提取標準（預算定額）
按規(guī)定標準提取醫(yī)療基金時，其會計分錄為：
借：事業(yè)支出——社會保障費
經(jīng)營支出——社會保障費
貸：專用基金——醫(yī)療基金
在實際使用時，其會計分錄為：
借：專用基金——醫(yī)療基金
貸：銀行存款或現(xiàn)金
